Meine erste Vermutung: Querlenkerbuchsen. Das hatte ich. Ist dann aber in jedem Gang bis zum Beschleunigen in den 4, dass es beim Gaswechsel klackt (oder klopft). Meine waren bei 130tkm hin und sind es jetzt wohl nach weiteren 30tkm wieder - warum auch immer so früh.
Probier mal beim Anfahren nur die Kupplung schnell kommen zu lassen (ohne Gasgeben). Wenn es dann auch ist, würde ich die mal checken lassen. Es kann natürlich auch alles andere sein .

Es reicht schon wenn die Buchsen auch nur kleine Risse haben und besonders bei dem Drehmoment vom Diesel sind die stärker belastet, wenn man sich auch mal überlegt, dass es dieselben Buchsen auch beim 54PS Polo drinne gibt... . Ob die kaputt sind, kannst du auch gut sehen, wenn du Gas gibst und draußen einen gucken lässt, ob sich das Rad stark nach hinten bewegt. Viel Erfolg! (Ich hoffe für dich fast, dass es das ist, denn das ist noch vergleichsweise "günstig" zu beheben).